基線數據收集和監測方案將解答許多問題，有助于確定減輕環境影響的戰略和作業控制。然而，一些議題超出了與作業有關的具體問題，無法通過監測和收集基線數據來解決。三亞研討會建議通過合作研究來處理這些議題。建議進行的研究項目包括：

1. 在深海進行沉積物劑量——響應實驗，以確定動物對掩埋的敏感度和掩埋后出現的動物演替情況。

2. 合作監測第一次采礦試驗，通過各商業實體和政府實體開展協作，從商業采礦的初步預采活動收集盡可能多的數據。

3. 研究采礦尾砂（廢物），以確定適當的處理方式或如何利用這種物質。

環境標準化問題研討會提出了進一步的研究課題，包括底棲物種的地理范圍及其基因流動的速率和空間范圍（不同種群雜交的程度），動物群落可以承受多頻繁的少量掩埋而不至面臨物種消失的威脅，群落需要多長時間才能從不同深度和程度的掩埋中恢復過來，以及群落的時空變化。

2002年在金斯敦舉行的研討會是專為擬訂環境合作研究項目而舉辦的。該研討會建議在結核領域開展四個項目。一些承包者和科研組織表示愿意參與這些項目，并提供研究船只、人員和實驗室。這些項目是：

1. 結核區內的生物多樣性、物種范圍和基因流動速率。

2. 深海動物對掩埋的敏感度和對采挖深海底結核所引起的擾動的反應，以及動物群落恢復能力的時空問題。

3. 在底層水、沉積物和結核廢物被提升到海面時，采礦作業的無用物質對礦址上覆水層的影響。

4. 深海生態系統的時空自然變化。

目前，管理局秘書處正與簽訂勘探合同的實體以及各政府組織和研究機構合作，推進這些研究項目的積極展開。